Nama Produk |
Ligase asam 3′-fosfat / 5′-hidroksi nukleat |
Contoh Struktur |
|
Sinonim |
3′-P RNL, MXAN_0280, MXAN_4982, ligase penyambungan RNA, rtcB, RtcB RNA ligase, Rtcb-1, RtcB1, Trl1, ligase penyambungan tRNA, ligase penyambungan tRNA |
Nomor EC |
6.5.1.8 |
Nomor CAS |
|
komentar |
Enzimnya adalah GTP- dan Mn2 + -tergantung 3′-5 ′ asam nukleat ligase dengan kemampuan untuk bergabung dengan RNA dengan 3′-fosfat atau 2 ′, 3′-siklik-fosfat berakhir dengan RNA dengan ujung 5′-hidroksi. Ia juga dapat bergabung dengan DNA dengan ujung 3′-fosfat ke DNA dengan ujung 5′-hidroksi, asalkan terminal DNA tidak berpasangan [6]. Enzim ditemukan dalam anggota dari ketiga kerajaan kehidupan, dan penting dalam metazoa untuk penyambungan tRNA yang mengandung intron. Reaksi mengikuti mekanisme tiga langkah dengan aktivasi awal enzim dengan hidrolisis GTP, membentuk ikatan fosforamida antara guanylate dan residu histidin. Gugus guanylate dipindahkan ke ujung 3′-fosfat dari substrat, membentuk struktur tertutup [DNA / RNA] -3 ′ - (5′-diphosphoguanosine). Ketika ujung 5′-OH yang sesuai tersedia, enzim mengkatalisis serangan 5′-OH di ujung yang tertutup untuk membentuk sambungan sambungan fosfodiester 3′-5 ', melepaskan guanylate. Ketika bekerja pada RNA 2 ′, 3′-cyclic-phosphate, enzim mengkatalisis reaksi tambahan, menghidrolisis siklik fosfat menjadi 3′-fosfat [9]. Enzim metazoan membutuhkan kofaktor pengaktifan untuk mencapai katalisis pergantian ganda [8]. |
Kofaktor |
Mn2 + |
Sejarah |
|
Reaksi |
(1) (Ribonukleotida) (n) -3′-fosfat + 5′-hidroksi- (ribonukleotida) (m) + Gtp = (ribonukleotida) (n + m) + gmp + difosfat. (2) (Ribonukleotida) (n) -2 ′, 3′-siklofosfat + 5′-hidroksi- (ribonukleotida) (m) + Gtp + H (2) O = (ribonukleotida) (n + m) + gmp + difosfat (reaksi keseluruhan). |